Différence entre les transposons composites et les éléments IS

Différence entre les transposons composites et les éléments IS

Le différence clé entre les transposons composites et les éléments est que Les transposons composites sont un type de transposons qui transportent des gènes accessoires tels que résistance aux antibiotiques Les gènes, tandis que les éléments (ou les éléments de séquence d'insertion) sont des éléments transposables qui ne portent que des gènes qui code transposase qui catalysent le transposition activité.

Un transposon est un fragment d'ADN qui peut changer sa position dans le génome bactérien. Par conséquent, ce sont des séquences d'ADN mobiles. Ils se déplacent dans de nouveaux emplacements du génome, apportant des changements dans la séquence du génome bactérien, provoquant des changements importants dans les informations génétiques. Les transposons sont également connus sous le nom de gènes de saut car ils peuvent bloquer la transcription des gènes et réorganiser le matériel génétique de la bactérie. De plus, ils sont responsables du mouvement de la résistance aux médicaments, des gènes de résistance aux antibiotiques entre les plasmides et les chromosomes. Les transposons composites et les éléments IS sont deux types d'éléments génétiques mobiles trouvés dans les bactéries. Les deux peuvent passer d'un endroit à un autre dans le génome.

CONTENU

1. Aperçu et différence clé
2. Que sont les transposons composites 
3. Qu'est-ce que les éléments
4. Similitudes entre les transposons composites et les éléments IS
5. Comparaison côte à côte - Transposons composites vs sont des éléments sous forme tabulaire
6. Résumé

Que sont les transposons composites?

Un transposon composite est un segment d'ADN flanqué de deux copies d'éléments de séquence d'insertion similaires. Il existe une région de codage des protéines central dans le transposon composite. Les gènes sont souvent des gènes résistants aux antibiotiques. Ils peuvent également contenir des gènes cataboliques. De plus, le transposon composite se compose de deux répétitions inversées. La longueur entière du transposon composite se déplace comme une unité complète.

Figure 01: Transposon composite

TN10 est un transposon composite. Il se compose d'un 6.5 kb région codante centrale (gène résistant à la tétracycline) et 1.4 kb Éléments de séquence d'insertion inversée à chaque extrémité. Les éléments alimentent la transposase. La transposase est une enzyme qui catalyse le mouvement du transposon. Les transposons composites peuvent être amplifiés, la conception d'amorces pour les éléments IS.

Qu'est-ce que les éléments?

Éléments de séquence d'insertion ou les éléments sont-ils un type d'élément génétique mobile. Ils sont une forme simple de transposons. Ils ne portent que les gènes codant pour les enzymes transposases. Les enzymes transposases catalysent la transposition de transposons. Structurellement, la séquence de codage des éléments est flanqué de deux répétitions inversées. Par exemple, l'élément appelé IS911 est flanqué de deux extrémités répétées inversées 36BP.

Les éléments sont les éléments transposables autonomes les plus abondants dans le génome bactérien. Par conséquent, ils sont extrêmement importants pour l'organisation et l'évolution du génome procaryote. De plus, les éléments se produisent comme des parties des transposons composites. Généralement, deux éléments sont trouvés flanquant la séquence de codage du transposon composite. Mais, les transposons unitaires ne transportent pas les éléments flanquants.

Puisque les éléments de l'EI peuvent se déplacer dans le génome, ils peuvent interrompre la séquence codante d'autres gènes et inactiver les gènes en bloquant l'expression.

Quelles sont les similitudes entre les transposons composites et les éléments?

  • Les deux transposons composites et les éléments sont capables de modifier la position dans le génome bactérien.
  • La région de codage dans les deux transposons est généralement flanquée de répétitions inversées.
  • Un transposon composite est flanqué de deux éléments séparés.

Quelle est la différence entre les transposons composites et les éléments?

Les transposons composites sont des éléments génétiques mobiles composés de deux séquences d'insertion (ISS) flanquant souvent un ou plusieurs gènes de résistance aux antibiotiques. D'un autre côté, les éléments sont un type d'élément transposable simple qui contient des gènes codant pour l'enzyme de transposase pour catalyser la transposition. Donc, c'est la principale différence entre les transposons composites et les éléments.

Vous trouverez ci-dessous une liste de différences entre les transposons composites et les éléments de la forme tabulaire pour la comparaison côte à côte.

Résumé - Transposons composites vs est des éléments

Un génome bactérien a des éléments génétiques mobiles. Les transposons composites et les éléments IS sont deux types d'éléments génétiques mobiles. Les transposons composites portent des gènes résistants aux antibiotiques et Flanking est des éléments. Les éléments portent le code génétique pour produire une transposase qui catalyse le mouvement des transposons. Ainsi, c'est la principale différence entre les transposons composites et les éléments.

Référence:

1. Tansirichaiya, Supathep, et al. «Détection PCR basée sur la PCR des transposons composites et des unités translocatives de l'ADN métagénomique oral.»FEMS Microbiology Letters, Oxford University Press, sept. 2016, disponible ici.
2. Griffiths, Anthony JF. «Séquences d'insertion bactérienne.«Une introduction à l'analyse génétique. 7e édition., U.S. Bibliothèque nationale de médecine, 1er janvier. 1970, disponible ici.

Image gracieuseté:

1. «Composite Transposon» de Jacek FH - Auto-fabriqué, basé sur l'image: Transposon composite.JPG (CC BY-SA 3.0) via Commons Wikimedia