Différence entre le gène candidat et le GWAS

Le différence clé entre le candidat Gene et GWAS est que L'approche du gène candidate étudie la variation génétique au sein d'un petit nombre de gènes d'intérêt pré-spécifiés tandis que GWAS étudie l'ensemble du génome pour une variation génétique courante derrière une maladie particulière.

L'approche des gènes candidats et les études d'association à l'échelle du génome (GWAS) sont deux méthodes qui sont importantes pour détecter la sensibilité génétique aux maladies. L'approche du gène candidate est basée sur un petit nombre pré-spécifié de gènes tandis que GWAS est basé sur le test de l'ensemble du génome. Par conséquent, l'approche du gène candidate nécessite une connaissance préalable des gènes pertinents pour la maladie, contrairement à GWAS.

CONTENU

1. Aperçu et différence clé
2. Qu'est-ce que le gène candidat 
3. Qu'est-ce que GWAS
4. Similitudes entre le gène candidat et le GWAS
5. Comparaison côte à côte - gène candidat vs gwas sous forme tabulaire
6. Résumé

Qu'est-ce que le gène candidat?

L'approche du gène candidate est l'une des techniques qui étudie l'association entre la variation génétique au sein des gènes pré-spécifiés d'intérêt et des phénotypes ou des états pathologiques. Dans cette approche, il est nécessaire d'avoir une connaissance préalable de l'impact fonctionnel biologique du gène sur le trait ou la maladie en question. Sur la base de ces connaissances, un petit nombre de gènes sont sélectionnés et analysés pour la variation génétique.

Figure 01: approche du gène candidat

La sélection des gènes est faite sur la base de la pertinence biologique, physiologique et fonctionnelle pour la maladie en question dans cette approche. Cette approche est souvent conçue comme une étude cas-témoins.

Qu'est-ce que GWAS?

GWAS signifie une étude d'association à l'échelle du génome. Il se réfère également aux études d'association du génome entier. Ces études se concentrent principalement sur les études d'observation. Ils analysent les variantes génétiques de différents individus généralement associés à un trait spécifique. L'ensemble du génome est important pour l'analyse GWAS.

GWAS est un outil important dans l'analyse des polymorphismes mononucléotidiques associés à diverses affections pathologiques. Il s'agit d'une étude comparative des différents polymorphismes un seul nucléotide à travers une large population. L'échantillon d'étude de GWAS est très élevé; Par conséquent, il prend également le format d'une étude de cohorte transversale.

Figure 02: GWAS

La première étude GWAS a eu lieu en ce qui concerne l'infarctus du myocarde et l'analyse des gènes associés à l'infarctus du myocarde. À l'heure actuelle, GWAS joue un rôle important dans la détermination du contexte génétique des maladies complexes avec une étiologie inconnue.

Quelles sont les similitudes entre le gène candidat et le GWAS?

• L'approche des gènes candidats et les GWAS sont des techniques qui analysent l'association génétique entre le génotype et le phénotype de la maladie.
• Les deux approches aident à comprendre la base génétique de la sensibilité à la maladie.

Quelle est la différence entre le gène candidat et le GWAS?

L'approche du gène candidate est basée sur les gènes candidats ou les gènes pré-spécifiés, tandis que GWAS est basé sur l'ensemble du génome. Donc, c'est la principale différence entre le gène candidat et le GWAS. De plus, dans l'approche du gène candidate, la sélection des gènes est nécessaire bien qu'elle ne soit pas nécessaire dans GWAS.

De plus, l'approche du gène candidate nécessite des connaissances antérieures sur les gènes pertinents pour la maladie, bien qu'il ne soit pas nécessaire pour GWAS.

L'infographie ci-dessous fournit une comparaison plus détaillée liée à la différence entre le gène candidat et le GWAS.

Résumé - Gene candidat vs GWAS

Gene et GWAS candidats sont deux études d'association génétique. L'approche du gène candidate se concentre sur la variation génétique associée à la maladie au sein d'un petit nombre de gènes pré-spécifiés. En revanche, GWAS étudie la variation génétique associée à la maladie dans l'ensemble du génome. Donc, c'est la principale différence entre le gène candidat et le GWAS. Les deux méthodes sont importantes pour comprendre la base génétique de la sensibilité à la maladie.

Référence:

1. «Gene candidat - un aperçu | Sujets scientifiques ». ScienceDirect.Com, 2020, disponible ici.
2. «Gene candidat». En.Wikipédia.Org, 2020, disponible ici.

Image gracieuseté:

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2. «Plot de Manhattan» par m. Kamran Ikram et al - Ikram Mk et al (2010) Quatre nouveaux loci (19q13, 6q24, 12q24 et 5q14) influencent la microcirculation in vivo. PLOS Genet. 28 octobre 2010; 6 (10): E1001184. doi: 10.1371 / Journal.pgen.1001184.G001 (CC par 2.5) Via Commons Wikimedia