Différence entre le knockout gène et le knockdown
Le différence clé entre le knockout de gène et le knockdown est que le Gene Knockout est une technique où le gène d'intérêt est complètement supprimé (état inopérant) pour étudier les fonctions du gène tout en Gene Knockdown est une autre technique où le gène d'intérêt est réduit au silence pour étudier le rôle du gène particulier dans un système biologique.
Différentes techniques génétiques sont en service pour étudier le fonctionnement des gènes dans les systèmes biologiques vivants. Gene Knockout et Knockdown sont deux de ces techniques. Ces techniques aident les scientifiques à identifier les aspects fonctionnels de différents gènes dans les organismes vivants.
CONTENU
1. Aperçu et différence clé
2. Qu'est-ce que Gene Knockout
3. Qu'est-ce que Gene Knockdown
4. Similitudes entre le knockout gène et le knockdown
5. Comparaison côte à côte - knockout gène vs knockdown sous forme tabulaire
6. Résumé
Qu'est-ce que Gene Knockout?
Gene Knockout est une technique génétique qui rend un ou plusieurs gènes inopérants dans les organismes vivants. Il s'agit également d'un processus de désactivation ou de suppression d'un gène d'un organisme. L'application principale de cette technique est d'étudier la fonction gène. Le processus évalue l'effet du gène perdu ou supprimé. Le processus knockout implique également certaines enzymes et techniques d'épissage.
Figure 01: KO GENE
Il existe peu de variations dans la technique de knockout gène basée sur le nombre de gènes impliqués. Ils sont double knock-out (KO de deux gènes), triple knock-out (knock-out de trois gènes) et quadruple knock-out (KO de quatre gènes). Gene Knockout est en outre classé en deux groupes; knockouts hétérozygotes et knockouts homozygotes.
Qu'est-ce que Gene Knockdown?
Le knockdown du gène est une procédure expérimentale où cette procédure supprime ou réduit l'expression d'un gène ou de gènes particuliers d'un organisme. Silençage des gènes est la définition commune du knockdown gène. Au cours de cette procédure, l'activation ou la dégradation de l'ARNm produit implique une interférence d'ARN (ARNi), un petit ARN interférant (siRNA) et l'ARN en épingle à cheveux courte (shRNA).
Figure 02: silençage des gènes
L'utilisation principale du knockdown gène est d'étudier le rôle du gène particulier dans le système biologique. Par conséquent, cette technique accomplit l'étude des oncogènes (Bcl-2 et P53) et des gènes qui provoquent des maladies neurologiques, des infections virales et des maladies héréditaires.
Quelles sont les similitudes entre le knockout gène et le knockdown?
- Gene Knockout et Gene Knockdown sont des techniques génétiques.
- Ces deux techniques peuvent empêcher l'expression des gènes.
- L'utilisation principale des deux techniques est d'étudier la fonction du gène d'intérêt.
- Les deux sont capables d'identifier différentes maladies (génétique).
- Ils pourraient tous les deux être utilisés pour un ou plusieurs gènes d'intérêt.
Quelle est la différence entre le knockout de gène et le knockdown?
Gene Knockout vs knockdown | |
| Knock-out gène est l'obligation des gènes (élimination des gènes de l'ADN) d'un organisme à travers différentes techniques génétiques. | Knockdown du gène est une procédure expérimentale pour supprimer (réduire ou silence) l'expression d'un gène ou de gènes particuliers d'un organisme. |
| Fonction | |
| Facilite l'étude des fonctions des gènes en analysant les résultats du gène perdu. | Facilite l'étude des oncogènes, des gènes qui provoquent des maladies neurologiques, des infections virales et des maladies héréditaires. |
| Implication des agents d'ARN | |
| L'implication des agents d'ARN est insignifiante dans cette technique. | Le processus implique les agents tels que l'ARNsi, le shRNA et l'ARNi pour inactiver l'ARNm. |
| Utilisation d'agents chimiques | |
| Les agents enzymatiques sont utilisés. | Aucun agent chimique n'est utilisé. |
| Effet sur le gène | |
| Supprime complètement le gène de l'ADN. | Supprimer ou faire taire le gène. |
| Classification | |
| Double KO, Triple Knockout et Quadruple Knockout et hétérozygotes et homozygotes knockout sont différents types de knockout gène. | Aucun système de classification de ce type disponible pour le silençage des gènes. |
Résumé - Gene Knockout vs Gene Knockdown
Les deux techniques dont nous avons discuté ici; Le knock-out du gène et le knockdown sont des méthodes pour étudier les fonctions de différents gènes. Gene Knockout rend le gène inopérant pendant que le knockdown du gène silence le gène d'intérêt. Cependant, les deux procédures empêchent l'expression du gène. Différents agents sont capables d'accomplir ces deux processus. Gene Knock out est un type de suppression tandis que le knockdown du gène est un type d'inactivation. C'est la différence entre le knock-out du gène et le knockdown.
Référence:
1.Shaffer, Catherine. «Gene knockout contre knockdown.»Information-médicale.net, 12 février. 2018. Disponible ici
2.«Gene Knockout.»Nature News, Nature Publishing Group. Disponible ici
Image gracieuseté:
1.'Knockout mice5006-300' par Maggie Bartlett, nhgri. (Domaine public) via Commons Wikimedia
2.«RNAi-Simplified'By Matzke MA, Matzke AJM (2004) Planter les graines d'un nouveau paradigme. PLOS BIOL 2 (5): E133 doi: 10.1371 / Journal.PBIO.0020133., (CC par 2.5) Via Commons Wikimedia
