Différence entre la séquence conservée et consensus

Le différence clé entre la séquence conservée et consensus est que La séquence conservée fait référence à des séquences similaires d'acides nucléiques ou d'acides aminés qui se produisent dans différentes espèces ou de même pendant les générations tandis que la séquence consensus est une séquence nucléotide courante ou une séquence d'acides aminés trouvée dans une région hautement conservée d'ADN ou d'ARN ou de protéines.

Les organismes partagent des caractéristiques similaires et différentes. Lorsque vous étudiez les relations entre les organismes et les classifier, le génome ou la composition génétique des organismes est très important. Il existe des séquences nucléotidiques ou acides aminés qui sont courantes parmi les différents organismes. Une séquence conservée est une séquence d'acide nucléique ou d'acides aminés qui est cohérente parmi les espèces. Par conséquent, ils sont phylogénétiquement importants lors de la génération d'arbres phylogénétiques. Dans les séquences conservées, il existe des séquences nucléotidiques spécifiques qui sont plus courantes. Ils sont connus sous le nom de séquences consensuelles.

CONTENU

1. Aperçu et différence clé
2. Qu'est-ce que la séquence conservée
3. Qu'est-ce que la séquence consensuelle
4. Similitudes entre la séquence conservée et consensus
5. Comparaison côte à côte - séquence de consensus conservée vs sous forme tabulaire
6. Résumé

Qu'est-ce que la séquence conservée?

Une séquence conservée est une séquence d'acide nucléique ou une séquence d'acides aminés qui est similaire parmi les espèces. Par conséquent, il est cohérent à travers les espèces tout au long de l'évolution. Généralement, ces séquences sont maintenues par sélection naturelle. Ils restent inchangés loin de remonter l'arbre phylogénétique. Par conséquent, les séquences conservées sont importantes pour construire des arbres phylogénétiques. On pense que les séquences hautement conservées ont souvent une valeur fonctionnelle importante. Ils sont utiles pour identifier également les maladies génétiques. Cependant, les séquences conservées peuvent être des séquences d'acide nucléique codantes ou non codantes. De plus, les séquences conservées montrent des taux de mutation plus lents. Par conséquent, ils présentent des changements très minimes dans leur composition; Parfois, ils ne montrent pas de changements partout dans les générations.

Figure 01: séquence conservée

Les composants d'ARN des ribosomes sont présents dans tous les domaines de la vie, les séquences homéobox chez les eucaryotes et l'ARNm dans les bactéries sont plusieurs exemples de séquences hautement conservées. L'identification des séquences conservées est facile lorsque les approches de bioinformatique, en particulier l'outil d'alignement des séquences, sont utilisées. De plus, l'alignement de séquences multiples facilite la visualisation des séquences conservées.

Qu'est-ce que la séquence consensuelle?

Une séquence de consensus est une séquence couramment trouvée dans une région conservée donnée d'ADN ou d'ARN. C'est une séquence nucléotidique très spécifique. Par exemple, il y a une séquence consensue E. coli promoteurs, qui sont des séquences hautement conservées. De même, il y a une autre séquence consensuelle: ttgaca dans E. coli promoteurs au -35 aussi. Les séquences de consensus sont également connues sous le nom de «boîtes».

Figure 02: Séquence consensuelle

En plus de l'ADN et de l'ARN, les protéines ont également des séquences consensuelles d'acides aminés. Les sites de liaison aux protéines sont souvent représentés par des séquences consensuelles. Les enzymes de restriction ont également des séquences consensuelles. De plus, les sites d'épissage sont également des séquences consensuelles. Semblable aux séquences conservées, les séquences consensuelles peuvent être calculées et visualisées par des outils bioinformatiques.

Quelles sont les similitudes entre la séquence conservée et consensus?

• Les séquences conservées et consensuelles sont des séquences d'acides nucléiques ou d'acides aminés qui sont courants à travers les espèces.
• Les séquences conservées et consensuelles peuvent être visualisées par des outils bioinformatiques.
• Ils sont largement utilisés en biologie moléculaire.

Quelle est la différence entre la séquence conservée et consensus?

La séquence conservée est une séquence d'acide nucléique ou d'acides aminés qui est cohérente parmi les espèces tandis que les séquences consensuelles sont très spécifiques et couramment trouvées des bases ou des acides aminés dans une région conservée donnée. C'est donc la principale différence entre la séquence conservée et consensus. De plus, une autre différence entre la séquence conservée et la séquence consensus est que les séquences conservées sont phylogénétiquement importantes tandis que les séquences consensuelles sont souvent des sites de liaison aux protéines, des sites d'épissage, des sites de coupe enzymatique de restriction, etc.

Résumé - Séquence consensuelle conservée vs

Les séquences conservées sont les séquences d'acides nucléiques ou de protéines qui sont similaires parmi les espèces vivantes. Un promoteur, un site de liaison aux ribosomes, une origine de réplication et une séquence d'acides aminés de la protéine histone sont plusieurs exemples de séquences conservées. En revanche, les séquences consensuelles sont des bases spécifiques ou des acides aminés qui se trouvent plus couramment dans une séquence conservée donnée. -10 boîtes, -35 boîte de E. coli promoteur, sites de liaison aux protéines, sites d'épissage et enzymes de restriction des sites de reconnaissance sont plusieurs exemples de séquences de consensus. Ainsi, c'est le résumé de la différence entre la séquence conservée et consensus.

Référence:

1. «Séquence conservée». En.Wikipédia.Org, 2020, disponible ici.

Image gracieuseté:

1. «Alignement des histones» par Thomas Shafee - Propre travaux (CC par 4.0) via Commons Wikimedia
2. «Séquence consensus de Kozak» par West0856 à Anglais Wikipedia (CC BY-SA 3.0) via Commons Wikimedia